در تاریخ چهارده معصوم (علیهم السلام) آمده است است كه از دلائل تاریخ معلوم میشود سه گنبد بر مرقد حضرت معصومه (علیهاالسلام) ساختهاند:
1- گنبدی كه به امر شاه بیگم دختر عماد بیك در سال 529 بنا كردند.
2- گنبدی كه در سال 925 به امر شاه اسماعیل صفوی ساختند.
3- گنبدی كه در سال 1218 به امر فتحعلی شاه ساخته شد.
این دو بیت هم منسوب به ایشان است:
خاقانم و یك جهان گناه آوردم در حضرت معصومه پناه آوردم
مِهر نبی و حبّ علی را یا رب بر درگه كبریا گواه آوردم
از سماء العالم نقل است كه سه مخدّره از بنات حضرت جوادالائمه علیه السلام در جنب مدفن و قبر مخدّره معصومه مسمّا به فاطمه دفن شدند از این قرار: مخدّره زینب، و مخدّره أمّ محمّد، و مخدّره میمونه.